1981年首届比赛只设男子项目。赛跑路线从天安门广场毛主席纪念堂东出发，经西单、五棵松至古城折返，沿原路至广播大楼，向南经宣武门、和平门、前门，再回到天安门广场。 整个路线基本上在长安街及延长线上，是历届马拉松赛最热闹的路线。

　　1983年第3届赛事路线改为从工人体育场出发，经东大桥、建国门，上长安街，向西至公主坟，再向北至北京外国语学院折返，沿原路至广播大楼，再沿前门大街至北京站，最后再向东回到工人体育场。

　　1984年比赛再次更改路线，从工体出发后，前半程路线同第3届相同，但至复兴门便向南拐，这一次是经过月坛公园、钓鱼台国宾馆、甘家口、阜成路，再折返经复兴门，以后沿前一届路线返回出发点。尽管第9届赛事开始增设女子项目，但除了把折返点向北推移至中国剧院以外，比赛路线并没有大的改动，并一直沿用到1997年。

　　1998年第18届赛事由于增加了半程和5公里小马拉松赛，赛跑路线变化比较大。出发地重新改在天安门广场，然后向西至复兴门，再向北经金融街口（小马拉松终点）、月坛北街，再向西经钓鱼台、航天桥（10公里终点）、到八里庄再向北至知春路（半程马拉松终点），然后沿京昌高速公路到清河桥折返，最后抵达终点奥林匹克体育中心田径场。

　　2000年北京国际马拉松赛路线又有变化，起点仍为天安门广场，但向西至复兴门后首先向南拐，然后再上西三环路向北，至北三环路，再至东三环路，终点则是朝阳公园大门前，这条路线持续了两年。2002年，路线西上万泉河路后北上直至八达岭高速辅路、规划中的奥运村，终点又回归到了北部的奥体中心，这条路线基本上沿用至今，其中的部分路程据称已与2008年北京奥运会的马拉松路线相吻合。

　　2005年的“全日空北京国际马拉松赛”路线只是进行了微调，选手们出发之后将西行至西四环辅路，随后才会北上万泉庄桥，其后路线与前两届相同。

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