在吴清源先生的年表里，有这样几个事件无法回避：1934年，吴清源作为"日满华围棋友好访问团"去伪满洲国和当年即位"满洲国"皇帝的傅仪下棋；1936年4月，在日本已侵占大片中国领土时，加入了日本国籍；1941年，与日本棋士们结成"棋道报国会"参加劳军；1942年，应汪伪南京政府顾问青木一男邀请，到上海慰问侵华日军。当时有爱国人士在饭店贴上"杀死夷化汉奸吴清源"的标语。正因为这几件事，有些人大骂吴清源是“汉奸”。但是，战后吴清源两次去台湾，都得到蒋介石的接见，后来还通过梅兰芳与周恩来交往，可见这两位抗日英雄并未把吴清源当“汉奸”。那么这几件事的内情又如何呢？
吴清源生活在动荡起伏的年代，彼时的中国甚至全世界，多少人如风中小草或地上蝼蚁，完全掌握不了自己的命运，即便是天作之才，慢说发挥才华，就连生命都不能保障，何谈创作与贡献？吴清源自幼痴迷棋艺，似专为围棋而生，为了继续棋道追求，一个弱冠少年在敌对的异国作出违心的事，也是形势所迫。
吴清源在晚年能每日只研究围棋，提出“21世界六合围棋”的理论，他视围棋的最高境界为“和谐”，最大心愿就是“推广围棋，为世界和平做贡献”。先生的自传《中的精神》自序中提到，“……可以说我的根就在中国的北京。虽然长期远离祖国，但我一直期望着中日友好出力的宿愿。……当初，我抱着通过围棋来实现中日友好的美好愿望东渡日本，现在，我祈盼“21世纪六合之棋”能为促进全世界各国之间的友好关系贡献绵薄之力。”
吴清源一度信奉“玺宇教”，为此彻底放弃最钟爱的围棋，他觉得每天念经就可以不打仗，每天祈祷就可以停止战争……
1934年在伪满洲国与溥仪下棋
1934年与溥仪下棋，吴清源在自传里是这样叙述的：
因为我是出生在福建，成长在北京--直到14岁去国赴日，所以每当我踏上中国的大地，总是感慨良多。特别是东北地区--战前在日本的扶持下建立了伪“满洲国”--更是一块让人百感交集的土地。
许多年前，我曾经访问过这里，也曾有过一次御前对局--在末代皇帝溥仪的龙座前下棋。那是1934年的事情了。
伪“满洲国”的首都设在长春，当时被改名称为新京。我和木谷实先生在宫殿里下了一盘棋，溥仪很有兴致地一直热心观战。我还用北京话和溥仪聊了几句，溥仪看上去十分高兴。
我和“满洲”还有另外一层因缘--我的大哥吴浣，战前曾经在伪“满洲国”宫内府任职。他由于厌恶日本军的蛮横粗暴，于是就趁随同溥仪的弟弟溥杰一起来日本之际，留在东京当上了一名外交官。大哥在战后去了台湾，现已去世。
……
在宫内府连续三天，我和木谷先生每天下棋一小时。溥仪穿着很华丽的装束，在我们下棋的三天里，每次都站在后面观战。但究竟溥仪是怎样的水平，倒是不了解。给我留下深刻印象的是溥仪手拿笔记本，十分热心地观战。
下完棋，大家在园子里喝茶。我因为会说北京话，所以溥仪很轻松地与我说话，问我在日本的成绩等情况。忽然，溥仪十分唐突地命令他身边的侍医与我下棋，让五子。溥仪又向我提出了一个十分苛刻的要求，说是要“把对手的子全部吃掉”。为了不让我全部吃掉，对手下得十分牢固小心。“吃掉对方全部”那是根本做不到的。
对世情想法简单的吴清源，似乎只把那次出行看做一次可以顺便看望哥哥的应酬权贵的活动，他记述到那次是从横滨出发，先到上海，然后青岛-北京-沈阳，最后经韩国回到日本。所到之处的主要活动就是与顾水如等名手下棋。
他接下来写到：
可以这样说，73年前我来到日本这件事本身，就肩负着改善中日关系的责任。当时，日本正企图侵略中国，两国关系日趋恶化。在十分险恶的形势下，因为得益于亲中派的犬养毅先生(原首相)的鼎力相助，我才得以来到日本。然而，遗憾的是，犬养毅先生在5·15(1932年)事件中被枪杀，随后立即爆发了侵华战争————那可真是一个黑暗的时代。对于经历了那样年代的我来说，十分希望21世纪能是一个相互友好、共存共荣的时代。只要一息尚存，我愿为加深各国之间的友好关系而走遍全世界。
第一次加入日本国籍
加入日本国籍是1936年的事。吴清源对此的记述视乎轻描淡写，完全没提到网上资料所说的“在日华侨强烈反对”。
第一次改国籍的详细记述是：
如果我一直保持中国国籍在日本继续围棋修业的话，终归怕有所不便。为此，山崎有民先生就劝我加入日本国籍。山崎先生是在北京的美术商，他为我来日本费尽周折和心血。因为中日关系越来越坏，后来山崎先生也回到了日本。
但是，加入日本国籍的手续非常麻烦，花了3年的时间。加入日本国籍要有各种条件，例如要在日本居住5年以上，要有稳定的生活等等。但其中最困难的其实还是要脱离中国的国籍。
当时，因为日本建立了伪“满洲国”，实际是侵略了中国，所以日本对蒋介石的国民政府来说是敌国。
去了好多次在东京的中国领事馆，但总是要被问到为什么要加入敌国国籍，尽管递交了申请，但总是遭到讥笑。
关于加入日本国籍的问题，濑越老师也很烦恼。老师他既不阻止，也不赞成，只是一直沉默。所以我去找了外交官的清水薰三先生商量。清水是中国通。清水先生找了中国的外交部，跟他们说：“你们即使留住吴清源的国籍也没有用。”由此说服了他们。
在日本的中国人，被蔑称为“支那人”，受到歧视，也有人受到过实际的威胁，因此，我对自身的安全也很担心。母亲和大哥都劝我回中国，或者去哪个学校上学。但是一边下棋一边读书是行不通的，再说我还要养活一家人。最后我决定一个人加入日本国籍，选择了留在日本。
电影《吴清源》的导演田壮壮在接受《南方周末》采访时说：“中日开战，吴清源觉得在日本没法呆了，打算回国。最早帮他去日本的濑越宪作跟他说：‘你要是回国，你就没有围棋了。’吴清源没有了围棋就跟鱼离开水一样，这不让他死吗？没有办法他当时只有选择围棋，留在了日本。”
吴清源的自传中提到了“继续围棋修业”的理由，但更实实在在的原因是“我还要养活一家人”。战争机器一旦开动起来，岂是一个普通个体所能阻止的，保全自己和家人也是人之常情。
1942年，到上海“慰问侵华日军”
1942年，应汪伪南京政府顾问青木一男邀请，到上海慰问侵华日军。当时有爱国人士在饭店贴上"杀死夷化汉奸吴清源"的标语。关于上述记载，吴清源自传中这样写道：
我是和木谷实先生一起升为八段的，时在1942年。虽然当时也有中部《日本新闻》社(现在的《中日新闻》)等三家新闻社联合主办了我和木谷实的三番棋，但由于已经完全进入战争的环境，不仅正式的比赛越来越少，还要去釜石(岩手县)的钢铁厂进行慰问，或是去和伤病员下棋。
同一年，还和濑越老师、师兄桥本宇太郎一起访问了中国。那是当时担任“大东亚大臣”的青木一男先生邀请濑越老师去中国南京的。青木先生十分喜欢下围棋，桥本先生以前一直和他下指导棋。
桥本先生在南京市内看见我的人头像和悬赏金就是在这个时候——我的模拟像上写着“吴清源文化汉奸(卖国奴)”。
吴清源对此事的描述仅限于此，莫非他当时和现在，都认为那只是陪同老师和师兄去与一位他们认识的棋迷官员下棋？我觉得如果细究此时，关键点是他在南京是只作为私人活动与青木等下棋，还是也参加了其他公开活动，可惜这似乎已不好考证。
1946年，改回中华民国国籍
吴清源在自传中专门有一章记述此事。
说一说我的国籍。出生于中国的我，到了日本后的头8年里，都还是中国国籍。后来随着战争的进一步升级，我加入了日本国籍，一直到战后。
到了1946年，突然有一天，一些在日华侨来到我家，并且拉着我去了我所住的杉并区的派出所。他们强迫我放弃日本的国籍。因为他们是让我等在另一个房间里，所以他们是怎么具体操作的我一点都不知道。后来，他们交给了我一本中国的临时护照。
当时正好是我和桥本宇太郎先生的第一次十番棋开始的时候。第一局我输了后，那些华侨又来了，说"输得这么难看，像你这样的人要了也是没用的"，结果他们又把临时护照从我手上拿走了。
后来，拿到正式护照已经是1949年以后了。那一年，中国的国民党在内战中战败，去了台湾。我去了在横滨的中华民国领事馆办手续，终于拿到了护照。在此之前，我三年没有国籍。
妻子和我一样在1946年失去了日本国籍，实际上一直也处于无国籍的状态。而我们是1952年才发现这个情况的。当时正好刚赢了和藤泽库之助先生的十番棋，就收到了台湾来的邀请函。
妻子去申请护照的时候，才发现自己竟然是没有国籍的，便一边找律师商量，一边办手续，终于又恢复了日本国籍。失去日本国籍的真相是，1946年那些华侨冲到派出所，杉并区派出所的工作人员对他们说："不是本人的话，是不能办理退国籍手续的。"对此，华侨们怒吼道："战败国的国民说什么呢！"然后就强词夺理地将我和我妻子的日本国籍都退掉了——那是日本刚刚战败后十分混乱的时候发生的事情。
拿到了护照，决定去台湾。这时周围有人开始担心我会不会是一去不复返，不再回日本了。因为在战时，加入日本国籍的我是曾被人贴出了悬赏告示的，所以这次如果去台湾，很有可能会和我算旧账。
在东京举行了饯别会，作家川端康成先生和村松逍风先生都来了。席间，川端先生还对我说："吴君，还是不要卷入政治的好。"看得出他很为我担心。
再加入日本国籍
我于1979年再次加入了日本国籍，时年65岁。战前，从中国国籍转为日本国籍，是因为当时是战争年代，受形势逼迫不得已。再次加入日本籍，较之我自己，更多的是考虑到孩子。
小儿子昌树在考高中的时候，碰上了这样的事情——在考场里只有小儿子一个人被叫到一边，不和大家排一个队。具体的原因不知道，但估计是国籍的关系才会这样吧。这件事对小儿子的打击很大。
我和妻子都为孩子的将来着想。在找工作的时候，可以想像如果没有日本国籍，情况会更糟糕。所以我们决定再次加入日本国籍，这也是小儿子的希望。
但是，要说再加入日本国籍，并不是马上就能被认可的。日本是不允许双重国籍的，如果我没有退出中国台湾籍的证明就拿不到日本国籍。为这事，我还去了原法务大臣稻叶修先生那里去找他帮忙。因为这个手续十分麻烦，花费的时间相当长，所以我连母亲的葬礼也没有去。
国籍问题解决了，小儿子从早稻田毕业后，在"日本电气"工作。长子信树庆应大学中途退学后，进了侗朋大学，立志成为音乐家。女儿佳澄从成蹊大学毕业后教初学围棋的启蒙班。
两次赴台 受到蒋介石接见
1952年第一次到台湾，吴清源夫妇受到热情接待，吴清源被授予“大国手”称号。自传里说本来要授予他“棋圣”称号，“但我听说之后，婉言谢绝了。"圣"这个字在中国只有像孔子那样的人才能称得上，我是实在不敢当。所以他们才改赠我"大国手"的称号。”这次台湾之行还确立了与当时仅10岁的林海峰的师徒关系。
自传在记述1965年第二次去台湾时，提高了1952年见蒋介石的场景，“1952年第一次见到蒋介石的时候，他穿着军服，给人很可怕的印象。但这次却完全不同，像一位和蔼的老爷爷。”。
1965年第二次去台湾，吴清源记述道：
1965年，我的弟子林海峰在获得第四期名人战冠军"名人"称号后，和我一起受到了台湾方面的邀请。林海峰当时还只有23岁，就成为了历史上最年轻的"名人"。
我们应邀来到蒋介石的私邸，受到蒋介石的接见。蒋介石睡了午觉后来到了会客室，穿着十分宽松的中式服装。
随后我们到院子里合影留念。私邸的院子没有我想像的那么大，我想是有意安排在私邸招待我们的。
蒋介石对我说："在什么地方发现的，学生？"这句话的意思是"很不错，发现了这样的棋手"。"学生"这个词在台湾是经常用的词汇。这是夸奖我的话。然后他对林海峰说"要读《大学》"，意思是说要学习了解人类的本质吧。
吴清源还在自传里饶有兴趣地对蒋介石的名字进行了品评，“"介石"一般被理解为像石头一般坚硬，带有顽固的意思。但是，我对此却有不同的理解。"介"在从前和带草字头的"芥"是同一个字，意思是草。草和石，就像电和磁场的组合一样，立刻会有所感应。所以，"不终日"后，成为了"吉"。"介石"是寓意着阴阳中和意思的名字。蒋介石的父亲有着很深的古代汉字的造诣。”
通过恩师与周恩来交往
战前在中国我就和梅兰芳见过面。当时我14岁，梅兰芳34岁。我记得梅兰芳还对我说过这样的话："去了日本，早点有出息。"
我去他在东京下榻的饭店拜访他。梅兰芳立刻就问我："要让中国的围棋强大，该怎么做好呢？"我回答说："首先要挖掘出天才，然后让他来日本留学。"。
几个月后，我接到了梅兰芳从中国寄来的信，说是已经找到了两个少年天才：陈祖德和陈锡明。随后就开始讨论怎么让那两个天才少年来日本留学的事宜。但是，正要开始办理留学手续的时候，长崎发生了日本人焚烧中国国旗事件，马上就升级成外交问题——围棋留学计划也随之告吹了。
1960年，濑越宪作老师作为友好围棋访问团的团长去了中国。因为濑越老师对中国共产党的情况一点都不了解，这让他很担心："去了那里，不会有问题吧。"来迎接的中国方面似乎看出了他的担心，就跟他开玩笑说："不要害怕。共产党是不吃人的。"但是，濑越老师是一位很认真的人，跟他开那样的玩笑是行不通的。
濑越老师一行在北京受到了周恩来总理的接见。周恩来总理说："下次请一定要带着吴清源一起来中国。我保证让他回日本。"回国后，濑越老师跟我说了这番话。但那番话在我听起来却很不是滋味。我本来就是中国人，根本没有回或不回的问题。不过，能够得到周恩来总理的高度评价，我还是非常高兴的。
1962年陈祖德为中日友好围棋访问团成员访问日本，出发前周恩来总理还把他叫去了，说："到了日本，要亲自登门拜访吴清源。"
蒋介石两次接见吴清源，周恩来对他的高评价，两位伟人都没有把吴清源视为“汉奸”，吴清源改换国籍等事他们不可能不知道，既然当时都不追求，我们作为后人更没必要抓住不放了。
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