国家队对于于根伟来说，感觉已经有些遥远和陌生了，不仅因为他已将近两年时间没有被征召入队，而且自韩日世界杯后他便将全部精力都投入到了俱乐部队中。
实际上于根伟渐渐淡出国家队完全是出于他自己的选择。于根伟当初在米卢手下始终无法跻身主力的境遇曾让他耿耿于怀，天性高傲而且实力突出的他，与个性桀骜的米卢注定无法走到一起，因此也曾爆发过冲突和不愉快，如果不是祁宏停赛，于根伟不会有机会完成那脚射门，也断然不会成为中国足球的英雄。世界杯期间，尽管中方教练组力挺于根伟，但米卢还是坚持不让他首发，只是当时的于根伟已经很淡然了，在他有些无奈地说出"我不想再为难老米，也不想再为难我自己"的时候，实际上就已经宣布自己从国足的归隐了。
与米卢，与任何教练一样，阿里-汉同样不能回避于根伟的天赋和实力，当他系统地观察了中国联赛后，多次提及于根伟是中国目前最出色的进攻型球员。但同样讲求态度决定一切的阿里-汉，也由于几次误会，渐渐否定了于根伟，他曾经对身边的密友说："我不会再召于根伟了，因为他深深地伤害过我两次。"汉所谓的两次被伤害的经历，一次是在国足与爱沙尼亚队比赛前：于根伟在有伤的情况下依然在中巴之战尾声替换上场并再次被踢伤，但汉希望他能够参加中爱之战，在遭到拒绝后他认为于根伟的态度有问题。第二次是在世界杯小组赛的中马大战前，当时中国队在天津与匈牙利队进行热身赛，已经意识到国足进攻能力薄弱的汉，不得不同意征调于根伟，在他看来于根伟不会拒绝这次在家门口亮相的机会，但凑巧的是在此前与沈阳金德队的比赛中，于根伟又被对手踢伤，尽管泰达俱乐部为此向国管部请假，但固执的汉还是认为于根伟再一次选择了逃避。
其实于根伟与阿里-汉之间的隔阂很大程度上还是起源于伤病，于根伟在经历了多次严重伤病以及出国疗伤后，大大加强了自我保护意识，他曾经很遗憾地说："如果当年不是为了天津队冲A，保级而屡次耽误手术，影响恢复，也许我早就可以出国踢球了，也许你们现在看到的就是一个更强的于根伟了。"因此于根伟现在每次受伤后都会格外重视休养，如果未到球队生死攸关的时候，无论是教练组还是他自己，都不会让他冒险出战。而且目前于根伟坚持着一个习惯，在训练和比赛后他一定要长时间对膝盖进行冰敷。津文
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