即使走了，法布雷加斯仍将作为阿森纳历史上最伟大的球员之一被铭记。他在这里完成了从青涩到成熟的蜕变，在这里接过维埃拉的枪杆，在这里成长为英超乃至世界足坛最好的中场组织者之一，更重要的，通过温格的培养和英超的锤炼，他成为足坛年少成名的经典案例。
“莫扎特在6岁时就能弹非常好的钢琴了，我永远也弹不了那么好。而一些球员17岁的水平，也是我踢球时从来不曾达到过的。为什么？因为他们都是特殊的天才。”向来以挖掘璞玉著称的温格，其执教生涯最为人津津乐道的育才案例，肯定是法布雷加斯。2003年，16岁的塞斯克被温格从拉玛西亚带到了海布里，当时有英国媒体质疑教授的眼光，“温格也有选人犯昏的时候。”但很快，英国媒体发现，这个来自拉玛西亚青训营的孩子是少见的天才和未来的大师。
16岁零177天时，法布雷加斯代表阿森纳一队踢了正式比赛，那是2003年10月的联赛杯；16岁零212天时，他成为俱乐部历史上最年轻的进球者，当时和狼队的联赛杯，他打入一球，帮助阿森纳5比1大胜；17岁零103天，他又刷新了代表俱乐部出战英超的低龄纪录，因为维埃拉受伤，2004-2005赛季他在联赛首度首发后就连续出场，打破布莱克本的球门；之后的欧冠联赛，他打破洛辛堡的大门，成为这项赛事最年轻的入球者。2004-2005赛季的足总杯，他首发出场，最终和队友一道，击败曼联夺冠，这是他在阿森纳捧起的第一座奖杯，那时，他不过18岁。
2006年夏天，维埃拉离开，法布雷加斯很快让球迷忘记法国铁腰，他成为阿森纳新的攻防枢纽，用他超乎年龄的成熟的传球，将球队的进攻梳理得流畅而犀利。这个赛季，他助攻达到13次，高居联赛第二，并被意大利媒体授予金童奖，同时被提名英格兰足球先生和职业球员工会年度新秀，当个赛季，他以60%的选票当选阿森纳赛季最佳球员。
即使亨利离开，法布雷加斯依旧掌控着阿森纳的航向。才20岁的他早已是枪手的领袖，在他的带领下，阿森纳直到3月还在联赛积分榜领跑。这一年，他赢得职业球员工会年度最佳新秀。
下一个赛季，对法布雷加斯而言非常重要。尽管阿森纳仍未赢得锦标，但因为加拉在更衣室引发内讧，才21岁的他戴上了阿森纳的队长袖标，他正式成为枪手竞技和精神上的领袖。遗憾的是，因为膝盖韧带撕裂，他缺席了四个月的联赛。
随后的两年，随着阿森纳继续与奖杯无缘，在欧锦赛和世界杯取得巨大成功的法布雷加斯陷入转会巴萨的肥皂剧。因为对阿森纳俱乐部投入的失望，他很想回到巴萨寻求职业生涯的突破，这种念头在阿森纳连续7年拿不到奖杯后变得异常强烈，以致他情愿牺牲巨大的个人利益，才促成这次交易。