本次奥运会预选赛亚洲赛区的比赛将分三个阶段进行：第一阶段先由弱队进行一轮主客场淘汰赛，总比分取胜的队进入下一阶段；而种子队则轮空；第二阶段比赛由通过第一阶段比赛的球队与种子队捉对厮杀，产生１２个胜者，再进行下一阶段比赛；第三阶段比赛则是１２支球队分成３个小组，每组有４支球队，采用主客场制，每个小组的头名将代表亚洲参加２００４年雅典奥运会。

　　在９日的分组抽签仪式中，首先是抽第一阶段比赛的对阵形势，具体是由Ｃ档次的球队与Ｅ档次的球队逐一对阵、Ｄ档次的球队与Ｆ档次的球队逐一进行对阵。随后是抽第二阶段的对阵形势，具体是先把１２个种子队分成Ａ、Ｂ两个档次，然后再把Ｃ档和Ｅ档中的胜队对阵Ａ档中的球队、Ｄ档和Ｆ档中的胜队对阵Ｂ档中的球队。