李世石宣布退出棋坛1年半时间，这大部分是因为他与韩国棋院恶劣关系所致。作为韩国棋院的头号招牌与摇钱树，李世石与韩国棋院交恶主要有四个原因。

　　一、不参加韩国围棋联赛

　　在今年4月底，李世石正式作出了不参加韩国围棋联赛的决定，这直接导致了韩国棋院与李世石接近决裂的态势。由于李世石要参加中国围甲比赛，围甲比赛基本上都安排在周四或者周六，而韩国围棋联赛也安排在周三-周日之间。这导致李世石频频在围甲与韩国围棋联赛的时间上撞车。此前，多次有李世石成为空中飞人参赛的情景。

　　贵州百灵队签约李世石的价格为赢一盘奖金人民币10万元。而在韩国围棋联赛中，李世石要赢10盘棋，才能得到10万报酬。该参加哪个，该放弃哪个。是很容易判断的事情。

　　但是李世石退出韩国围棋联赛，直接导致韩国围棋联赛的影响力与看点减少。相当于砸了大多数韩国棋手的饭碗，引起公愤，实在是意料之中的事情。

　　二、不上缴围甲奖金的5

　　%韩国棋院规定，棋手需要将奖金的5%上缴给韩国棋士会。在2008年，李世石在围甲一共取得了疯狂的8连胜，获得了80万元人民币的奖金。李世石认为，到围甲打工完全是自己的行为，在日程上，韩国棋士会并没有给予过任何的照顾，所以不该上缴这5%。

　　三、不在棋谱著作权方案上签字

　　韩国棋院就棋谱著作权的问题已经提出好多年了,别人都同意,只有李世石一直不签字。

　　四、不参加韩国联赛颁奖仪式

　　去年的韩国围棋联赛,颁奖时李世石没有参加。